Penafian: Artikel rilis awal tidak dianggap sebagai versi akhir. Setiap perubahan akan tercermin dalam versi online di bulan artikel ini secara resmi dirilis.
Afiliasi Penulis: Institut Penelitian Genomik Translasi, Flagstaff, Arizona, AS (WT Porter, DM Engelthaler, CM Hepp); Arizona State University, Phoenix, Arizona, AS (DM Engelthaler); Universitas Arizona Utara, Flagstaff (CM Hepp)
Pandemi SARS-COV-2 menyoroti pentingnya dan kemungkinan pengawasan genom untuk respons wabah dan pengawasan patogen. Keberhasilan besar proyek sekuensing SARS-COV-2 global, menghasilkan> 17 juta genom (1), mencerminkan upaya kolektif dan dedikasi komunitas kesehatan ilmiah dan masyarakat. Dataset yang tak tertandingi memungkinkan identifikasi varian virus dan kelompok kasus, pelacakan gerakan virus, dan meningkatkan pemahaman prinsip -prinsip evolusi. Didorong oleh peningkatan akses ke teknologi pengurutan dan analitik, usia kecerdasan patogen telah dimulai (2). Konsep itu melibatkan menerjemahkan genomik patogen ke dalam pengetahuan yang dapat ditindaklanjuti, seperti mendeteksi cluster wabah untuk intervensi transmisi (3,4), penanda resistensi antimikroba untuk memandu pengobatan (5), varian baru untuk mempersiapkan gelombang pandemi baru (6), dan karakterisasi jalur evolusi patogen untuk mengidentifikasi peluang mitigasi (7). Meskipun aplikasi tersebut sangat berharga, genomik modern dan daya komputasi memungkinkan perluasan lebih lanjut dari pengawasan genom dan penciptaan kecerdasan patogen skala besar.
Estimasi tren penyakit menular dapat mengambil manfaat dari kecerdasan patogen skala besar. Jumlah kasus sering dikacaukan oleh perilaku mencari perawatan, terutama ketika orang mengalami penyakit ringan atau tidak menunjukkan gejala atau ketika diagnosis menantang (misalnya, penyakit jamur lingkungan, seperti coccidioidomycosis), yang mengarah pada pelaporan yang kurang besar. Model statistik dapat memperkirakan kasus yang tidak terdeteksi dengan menggunakan data luar untuk memperhitungkan etiologi yang kurang dilaporkan atau tidak dapat dilaporkan. Namun, akuntansi yang kurang dilaporkan bukanlah masalah sederhana, terutama ketika mempertimbangkan peran yang dimiliki ketidakadilan sosial pada pelaporan lintas ruang dan waktu.
Pelacakan patogen di air limbah sangat berharga untuk memperkirakan tren kasus secara proaktif dan varian pelacakan di dekat waktu-nyata melintasi pandemi SARS-COV-2. Meskipun awalnya diterapkan pada saluran pembuangan di London untuk melacak Salmonella enterica di tahun 1940 -an (8), metodologi terus diperluas ke berbagai patogen. Misalnya, pengawasan air limbah untuk enterovirus D68, infeksi yang tidak dilaporkan tanpa adanya kelumpuhan lembek akut, berhasil dilakukan di komunitas perkotaan dan pedesaan dan berkumpulnya pengaturan kehidupan di paruh kedua tahun 2022 (De Erickson et al., Data unpub. https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.11.20.23297677v2). Pengetahuan tentang tren berbasis masyarakat untuk enterovirus D68 dan virus pernapasan lainnya dapat membantu dalam mengurangi potensi kekurangan albuterol yang didorong oleh eksaserbasi asma yang diinduksi virus pada anak-anak. Namun, pengawasan air limbah bukanlah solusi universal karena pelacakan yang akurat kurang berhasil untuk organisme yang secara minimal ditumpahkan melalui saluran gastrointestinal dan urin atau sangat rentan terhadap degradasi, yang menghasilkan sinyal genom suboptimal.
Dengan peningkatan akses ke data pengurutan, kita dapat memperluas kemungkinan kecerdasan patogen dan mengantarkan gelombang kedua epidemiologi genomik. Salah satu metode yang menjanjikan adalah filodinamika, yang melibatkan memanfaatkan keragaman genomik patogen dan memperkirakan tingkat koalesen untuk memperkirakan tren penyakit (9). Misalnya, tim kami bekerja dengan komunitas Apache jarak jauh di Arizona untuk melacak wabah SARS-COV-2 yang sebagian besar terisolasi pada tahun 2020 yang memiliki respons kesehatan masyarakat yang didorong oleh pengambilan sampel komunitas yang hampir lengkap (4). Regresi linier menunjukkan bahwa perkiraan ukuran populasi efektif yang diturunkan secara genom dari 36% kasus dengan genom berurutan menjelaskan 86% dari variasi total jumlah kasus dari waktu ke waktu. Namun, kami sedang menyelidiki peran yang mungkin dimiliki bias pengambilan sampel pada korelasi itu. Nonetheless, using phylodynamic methods to estimate disease burden could be invaluable for disease surveillance, enabling targeted and cost-effective programs that use remnant or prospective samples to estimate real-time disease dynamics, on the order of days or weeks, for pathogens that measurably evolve on those timescales (10). Komunitas genomik, kesehatan masyarakat, dan bioinformatik harus bersatu untuk mengklarifikasi bagaimana kita dapat secara rutin menerjemahkan sinyal genom patogen ke dalam tren transmisi informatif dan wawasan yang dapat ditindaklanjuti.
Pada intinya, estimasi filodinamik mengasumsikan bahwa, seiring waktu, patogen memperoleh mutasi pada tingkat yang konsisten, yang memungkinkan estimasi lintasan evolusi dan laju koalesensi. Prinsip itu mendefinisikan laju evolusi minimum teoritis yang dikombinasikan dengan ukuran genom atau wilayah berurutan relatif terhadap waktu generasi patogen. Sebelumnya, estimasi filodinamik terutama terbatas pada sistem virus (11), di mana laju mutasi yang lebih tinggi, periode replikasi pendek, dan populasi besar mendorong evolusi lebih cepat. Namun, teknologi sekuensing modern menyediakan daerah berurutan yang lebih besar, sehingga teknik -teknik tersebut telah digunakan dalam sistem bakteri (12) dan kemungkinan akan terus berkembang ke organisme nonviral.
Selain tingkat evolusi, sistem patogen adalah pertimbangan kritis untuk kesimpulan filodinamik. Dalam kasus paling sederhana, penularan manusia-ke-manusia langsung dan berturut-turut memungkinkan perkiraan filodinamik untuk secara langsung berhubungan dengan tren penyakit manusia (10,13); Namun, model itu rumit oleh perkenalan patogen ke dalam populasi dan infeksi jangka panjang. Untuk patogen dengan siklus sylvatic, perkiraan filodinamik dari sumber non -manusia (misalnya, vektor) mencerminkan tren populasi lingkungan dan dapat menginformasikan risiko kesehatan masyarakat.
Skema pengambilan sampel harus dipertimbangkan karena variasi lintas ruang dan waktu tidak dapat dihindari di sebagian besar program pengawasan. Menjelaskan bagaimana variasi itu mempengaruhi kesimpulan filodinamik dan mengidentifikasi strategi pengambilan sampel yang optimal sangat penting bagi komunitas yang lebih besar. Akhirnya, ada banyak model statistik berbasis filogenetik untuk melakukan analisis tersebut (10,13,14); Namun, pengetahuan kami tentang kinerja program -program tersebut pada dataset yang berpotensi bias atau tidak representatif terbatas. Selain keakuratan, efisiensi dan keberlanjutan komputasi harus dianggap sebagai dataset genom terus tumbuh dan membutuhkan kesimpulan yang akurat dan cepat untuk memberikan wawasan yang dapat ditindaklanjuti. Investigasi multipathogen skala besar diperlukan untuk membandingkan kompleksitas komputasi, sensitivitas, dan spesifisitas estimasi filodinamik di seluruh skema pengambilan sampel, termasuk subsampling urutan genomik dan penciptaan periode dengan peningkatan atau penurunan upaya pengurutan. Analisis-analisis tersebut harus membandingkan temuan di beberapa model statistik berbasis filogenetik dan membandingkan hasil dengan tindakan yang ada, termasuk kasus yang dimodelkan secara statistik, karena analisis tersebut akan memungkinkan komunitas kesehatan ilmiah dan masyarakat untuk secara tepat mengidentifikasi ketika kesimpulan filodinamik memberikan kecerdasan yang dapat ditindaklanjuti.
Singkatnya, epidemiologi genom akan terus mengubah lanskap respon kesehatan dan wabah masyarakat dan menyoroti keunggulan pengumpulan intelijen patogen. Kami memiliki kemampuan dan tanggung jawab untuk lebih lanjut menerapkan prinsip -prinsip genomik ke dunia kesehatan masyarakat. Bahwa perluasan prinsip-prinsip harus melibatkan metode yang dikarakterisasi dengan baik, yang membutuhkan investigasi multidisiplin terapan di seluruh sistem patogen dan integrasi bias dunia nyata ke dalam penilaian mereka.
Mr. Porter adalah rekan peneliti di divisi patogen & mikrobioma Institut Penelitian Genomik Translational. Penelitiannya berfokus pada memanfaatkan genomik untuk menjelaskan bagaimana patogen bergerak melintasi ruang dan waktu.
Hello, sobat pengemar slots pernahkah denger istilah “slot demo”? jika tidak, siap-siap jatuh hati sama program ini. slot demo merupakan mesin slots yang sering kasih kemenangan. Ya, mesin-mesin ini bisa dibilang sebagai jagoannya tuk membawa come back cuan. any way, gimana sih caranya jumpain raja lot yang benar? Santai Bro, kita beri santai aja di tempat ini
Permainan tergacor waktu sekarang satu-satunya berada Indonesia hanya di yang menyediakan return on Investment terbaik
Daftar dengan:
Informasi mengenai KING SLOT, Segera Daftar Bersama king selot terbaik dan terpercaya no satu di Indonesia. Boleh mendaftar melalui sini king slot serta memberikan hasil kembali yang paling tinggi saat sekarang ini hanyalah KING SLOT atau Raja slot paling gacor, gilak dan gaco saat sekarang di Indonesia melalui program return tinggi di kingselot serta pg king slot
slot demo gacor
slot demo gacor permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama kdwapp.com
akun demo slot gacor
akun demo slot gacor permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama kdwapp.com
akun slot demo gacor
akun slot demo gacor permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama kdwapp.com
akun demo slot pragmatic
akun demo slot pragmatic permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama kdwapp.com
akun slot demo pragmatic
akun slot demo pragmatic permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama kdwapp.com
akun slot demo
akun slot demo permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama kdwapp.com
akun demo slot
akun demo slot permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama kdwapp.com
slot demo gacor
slot demo gacor permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama jebswagstore.com
akun demo slot gacor
akun demo slot gacor permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama jebswagstore.com
akun slot demo gacor
akun slot demo gacor permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama jebswagstore.com
akun demo slot pragmatic
akun demo slot pragmatic permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama jebswagstore.com
akun slot demo pragmatic
akun slot demo pragmatic permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama jebswagstore.com
akun slot demo
akun slot demo permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama jebswagstore.com
akun demo slot
akun demo slot permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama jebswagstore.com
slot demo gacor
slot demo gacor permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama demoslotgacor.pro
akun demo slot gacor
akun demo slot gacor permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama demoslotgacor.pro
akun slot demo gacor
akun slot demo gacor permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama demoslotgacor.pro
akun demo slot pragmatic
akun demo slot pragmatic permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama demoslotgacor.pro
akun slot demo pragmatic
akun slot demo pragmatic permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama demoslotgacor.pro
akun slot demo
akun slot demo permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama demoslotgacor.pro
akun demo slot
akun demo slot permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama demoslotgacor.pro
slot demo gacor
slot demo gacor permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama situsslotterbaru.net
akun demo slot gacor
akun demo slot gacor permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama situsslotterbaru.net
akun slot demo gacor
akun slot demo gacor permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama situsslotterbaru.net
akun demo slot pragmatic
akun demo slot pragmatic permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama situsslotterbaru.net
akun slot demo pragmatic
akun slot demo pragmatic permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama situsslotterbaru.net
akun slot demo
akun slot demo permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama situsslotterbaru.net
akun demo slot
akun demo slot permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama situsslotterbaru.net
situs slot terbaru
situs slot terbaru permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama situsslotterbaru.net
slot terbaru
slot terbaru permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama situsslotterbaru.net
spy88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama spy88.biz
surga888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama surga888.biz
surgaplay88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama surgaplay88.biz
suzuki88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama suzuki88.biz
tahta88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama tahta88.biz
tahtatoto permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama tahtatoto.biz
target888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama target888.biz
targettoto permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama targettoto.net
taruhan777 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama taruhan777.biz
taruhan88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama taruhan88.biz
timnas88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama timnas88.biz
timnastoto permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama timnastoto.biz
titi88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama titi88.biz
tititoto permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama tititoto.net
tstoto88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama tstoto88.com
voxy888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama voxy888.biz
wasiat88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama wasiat88.biz
winslot888slot permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama winslot888slot.com
wintoto permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama wintoto.biz
yoda88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama yoda88.biz
zeusqq88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama zeusqq88.com
zeusqq88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama zeusqq88.info
zeusqq88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama zeusqq88.net
zeusqq88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama zeusqq88.org
99spin permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama 99spin.org
agen99 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama agen99.info
akademitoto88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama akademitoto88.com
alurtoto88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama alurtoto88.com
angka888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama angka888.com
angkasajp88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama angkasajp88.com
apk13 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama apk13.org
aurajp88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama aurajp88.net
balon18 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama balon18.com
bandar33 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama bandar33.net
bangsajp88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama bangsajp88.biz
batman13 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama batman13.com
bayar777 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama bayar777.biz
bbm88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama bbm88.biz
bengawantoto permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama bengawantoto.com
bento888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama bento888.biz
berkahslot88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama berkahslot88.biz
betsatu88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama betsatu88.com
bigo888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama bigo888.org
binjaitoto88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama binjaitoto88.biz
bolaslot888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama bolaslot888.biz
bri88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama bri88.biz
bro13 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama bro13.com
btv88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama btv88.biz
buah777slot permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama buah777slot.org
bursa7777 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama bursa7777.com
cair777 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama cair777.biz
ceriabet88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama ceriabet88.biz
cnnslot88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama cnnslot88.net
coblos88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama coblos88.biz
damar888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama damar888.com
dapattoto88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama dapattoto88.com
dapurtoto88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama dapurtoto88.com
day77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama day77.biz
demen88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama demen88.biz
detik228 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama detik228.biz
nagamastoto88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama nagamastoto88.com
narutobet88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama narutobet88.biz
narutobet88slot permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama narutobet88slot.com
ngamenjitu88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama ngamenjitu88.com
ninja13 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama ninja13.net
nusantara777 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama nusantara777.biz
nusantara888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama nusantara888.biz
ojol88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama ojol88.biz
pakarjp88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama pakarjp88.org
pasarslot88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama pasarslot88.biz
pasukkanjitu88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama pasukkanjitu88.com
pditoto88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama pditoto88.com
pejuangjitu88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama pejuangjitu88.com
petir333 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama petir333.biz
pf77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama pf77.net
pialatoto88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama pialatoto88.com
pijat88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama pijat88.com
pilkada88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama pilkada88.com
pion888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama pion888.biz
pluto888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama pluto888.biz
poa888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama poa888.biz
profit888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama profit888.biz
pupuk88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama pupuk88.org
puribet88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama puribet88.org
qqindah88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama qqindah88.com
qqstar888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama qqstar888.biz
roblox88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama roblox88.net
salamjp permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama salamjp.net
samson888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama samson888.com
semarjitu88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama semarjitu88.com
sensor88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama sensor88.org
sgmwin88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama sgmwin88.com
she77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama she77.net
shopee88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama shopee88.biz
sido888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama sido888.com
sikat888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama sikat888.biz
simba88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama simba88.asia
singgah88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama singgah88.biz
sip333 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama sip333.com
sip88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama sip88.biz
situs666 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama situs666.biz
